Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Trem1Q9JKE2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trem1Q9JKE2 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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