Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ybx3Q9JKB3 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Ybx3Q9JKB3 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ybx3Q9JKB3 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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