Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Tatdn3-202ENSMUST00000085633 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ms4a4bQ9ES61 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms