Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Swt1Q9DBQ9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms