Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Ms4a6c-201ENSMUST00000165310 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Sox5-205ENSMUST00000111749 3879 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms