Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmigd1Q9D7L8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms