Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sgms2Q9D4B1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms