Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Pramef12Q9D2F1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms