Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms