Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Lrrc17Q9CXD9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Lrrc17Q9CXD9 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms