Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Atp6v0e1Q9CQD8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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Atp6v0e1Q9CQD8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Atp6v0e1Q9CQD8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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