Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
RetnQ99P87 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms