Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cep41Q99NF3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cep41Q99NF3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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