Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hdac9Q99N13 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hdac9Q99N13 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hdac9Q99N13 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hdac9Q99N13 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hdac9Q99N13 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Hdac9Q99N13 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hdac9Q99N13 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Hdac9Q99N13 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Hdac9Q99N13 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hdac9Q99N13 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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