Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm38301-201ENSMUST00000195573 543 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprtQ99M80 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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