Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rab28Q99KL7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rab28Q99KL7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rab28Q99KL7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Rab28Q99KL7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rab28Q99KL7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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