Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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