Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Slc8b1Q925Q3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms