Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nek8Q91ZR4 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Nek8Q91ZR4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms