Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ssh3Q8K330 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ssh3Q8K330 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms