Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Abcf3Q8K268 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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