Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE96

Trmt6, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase non-catalytic subunit TRM6, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt6Q8CE96 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trmt6Q8CE96 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trmt6Q8CE96 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trmt6Q8CE96 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trmt6Q8CE96 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Trmt6Q8CE96 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Trmt6Q8CE96 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Trmt6Q8CE96 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trmt6Q8CE96 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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