Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Sfrp1Q8C4U3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Sfrp1Q8C4U3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Sfrp1Q8C4U3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sfrp1Q8C4U3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sfrp1Q8C4U3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.4 ms