Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

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Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp40Q8BWR4 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp40Q8BWR4 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp40Q8BWR4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp40Q8BWR4 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp40Q8BWR4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp40Q8BWR4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Usp40Q8BWR4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp40Q8BWR4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms