Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtpaQ8BWP5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms