Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NischQ80TM9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms