Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ube2q1Q7TSS2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ube2q1Q7TSS2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ube2q1Q7TSS2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ube2q1Q7TSS2 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ube2q1Q7TSS2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ube2q1Q7TSS2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ube2q1Q7TSS2 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms