Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shq1Q7TMX5 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 233.2 ms