Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LcorQ6ZPI3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms