Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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