Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q6DFW0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q6DFW0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Q6DFW0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms