Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtprjQ64455 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtprjQ64455 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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PtprjQ64455 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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PtprjQ64455 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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PtprjQ64455 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprjQ64455 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprjQ64455 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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PtprjQ64455 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtprjQ64455 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprjQ64455 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtprjQ64455 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprjQ64455 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprjQ64455 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprjQ64455 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprjQ64455 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprjQ64455 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtprjQ64455 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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PtprjQ64455 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms