Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Itga7Q61738 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms