Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
JrkQ60976 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms