Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Mkrn3Q60764 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mkrn3Q60764 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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