Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sin3aQ60520 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms