Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tmem253Q3UNB8 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms