Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trafd1Q3UDK1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms