Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q3U6N9 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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