Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Rnf40Q3U319 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnf40Q3U319 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rnf40Q3U319 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Rnf40Q3U319 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rnf40Q3U319 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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