Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms