Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cers3Q1A3B0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms