Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VgfQ0VGU4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms