Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Rbp2Q08652 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms