Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlh1Q02576 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms