Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HmgcrQ01237 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HmgcrQ01237 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms