Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin2bQ01097 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms