Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Tp53bp1P70399 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Tp53bp1P70399 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Tp53bp1P70399 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Tp53bp1P70399 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Tp53bp1P70399 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tp53bp1P70399 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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