Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg6P61406 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smg6P61406 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms