Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Polr2iP60898 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Polr2iP60898 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Polr2iP60898 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Polr2iP60898 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Polr2iP60898 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Polr2iP60898 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Polr2iP60898 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Polr2iP60898 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Polr2iP60898 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Polr2iP60898 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Polr2iP60898 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms